Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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NCF4Q15080 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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NCF4Q15080 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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NCF4Q15080 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCF4Q15080 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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