Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms