Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTTNQ14247 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTTNQ14247 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms