Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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ITGA9Q13797 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA9Q13797 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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