Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
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