Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOFQ13790 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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APOFQ13790 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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