Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LAMB3Q13751 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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