Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1SQ13698 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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