Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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