Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4AQ13619 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CUL4AQ13619 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CUL4AQ13619 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CUL4AQ13619 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CUL4AQ13619 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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