Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms