Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2Q13563 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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