Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC1Q13547 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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