Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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TUBB3Q13509 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TUBB3Q13509 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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