Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPM6BQ13491 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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