Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
XRCC4Q13426 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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