Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTGDRQ13258 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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