Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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