Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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