Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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