Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms