Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms