Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL9Q07325 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms