Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms