Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP7AQ04656 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms