Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms