Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms