Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH6A1Q02252 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms