Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms