Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms