Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms