Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB4BP68371 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms