Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms