Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms