Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME5P56597 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME5P56597 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME5P56597 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME5P56597 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms