Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms