Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPAP49450 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPAP49450 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms