Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYB561P49447 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYB561P49447 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms