Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms