Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCLMP48507 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms