Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC6A9P48067 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC6A9P48067 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms