Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms