Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCAMP43121 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCAMP43121 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCAMP43121 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCAMP43121 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MCAMP43121 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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