Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1E1P36543 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms