Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms