Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms