Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5DP30049 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms