Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms