Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCM3P25205 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCM3P25205 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCM3P25205 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms