Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HRCP23327 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HRCP23327 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HRCP23327 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HRCP23327 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HRCP23327 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HRCP23327 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HRCP23327 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HRCP23327 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HRCP23327 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HRCP23327 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HRCP23327 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HRCP23327 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HRCP23327 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HRCP23327 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms